1、概念不同
(1)商品房是由房地产开发企业开发建设并出售、出租的房屋。
(2)经适房是由国家统一下达计划，用地一般实行行政划拨的方式，免收土地出让金，对各种经批准的收费实行减半征收，出售价格实行政府指导价，按保本微利的原则确定。
2、土地供应方式不同
(1)商品房按现行法律规定要实行土地出让，交纳土地出让金。
(2)经济适用住房不交土地出让金，土地使用权国家划拨。
3、购买限制不同
(1)商品住房面向社会上所有人群，符合当地限购政策条件的情况下，只要有钱就可以去买，购房者可以根据自己的能力选择购买;
(2)经济适用房是有严格的标准以及审查程序的，申请人的住房面积、可收入支配、是否发生过住房交易等等都会影响到购房人的申请资格。
4、再交易限制不同
(1)商品房出售在拿到房产相关证件后就可以对房产进行处置。
(2)经济适用房的土地是由政府划拨的，所以购买者拥有的是不完全的产权，即使买了房也就只能拿到产权证，是无法拿到土地证的。日后一旦想要出让的话，只能在满足购买时间达到五年，并缴纳10%的土地出让金才可以进行出让。
5、定价不同
(1)商品房的价格受到市场的波动影响，是由开发商自己决定的，开发商一旦把地拍进以后，政府在通常情况下是不干预的。
(2)经济适用房的价格是由政府限定的。
6、户型及设计理念上不同
(1)商品房在设计上会比较讲究，大户型、实用性、装饰性和功能分区明确是商品房设计理念中的核心。而且市场上的商品房各种户型、各种面积大小的都很多，购买商品房的购房者可选择性较多。
(2)经济适用房主要突出经济、适用，因此，经济适用住房建设要体现适用、美观的原则，使用功能要满足居民的基本生活需要。在功能上要齐全，室内生活必需的设施要有，厅房要齐全;在面积上还要考虑到各地经济发展水平、住房水平、居民生活习贯有很大差别。以市场接受为前提，因地制宜地制定经济适用住房的面积标准。
