1、备案顺序不同：
两限房是先申请备案，有房子再参加摇号;自住房是先有房，之后再申请；
2、优先条件不同：
两限房的优先条件比较多：大病、老龄(超过60)、重残、军转、拆迁等等。
3、限价层次不同：
一般来说，两限房价格比较低，自住房价格相对较高，而且跟定周边房价，随市场浮动定价。不过，自住房的定价原则比较明确。
4、购房客户不同：
两限房严格限定了户口、收入和家庭资产，而且名下无房或人均住房面积特别小，低于一定数值，范围较小。即便如此，也有很多人在轮候，保障房始终是供不应求的。自住房则没有做出对收入和财产有过多限定，只要符合限购政策的客户都可以。
自住房与两限房如何买卖
1、自住房买卖：
自助房的购买只需要经历报名、核验、摇号、选房、后进行签约这些流程之后，开发商会与购房家庭签订购房合同，但是购房家庭的成员今后不得再申请购买自住型商品房。
而自住房的出售则是在取得房屋产权证5年后可以上市交易，交易部分30%返还市政府，且今后不允许购买自住型商品房。
2、两限房买卖：
两限房的购买需要先去社区居委会领张表，然后由办事处初审，合格后进入轮候，市里统一调整，或租或买有档次标准，主要看收入水平来判定。
限价房购房人在取得房屋权证或契税完税证明未满5年的，不得出售，确需出售的政府折旧后回购。满5年的，购房人应按同地段普通商品住房和限价房价格之差的35%上交土地金，上交后可以转让。
两限房是什么
两限房全称为限房价、限套型普通商品住房，也被称为“两限”商品住房。两限房指经城市人民政府批准，在限制套型比例、限定销售价格的基础上，以竞地价、竞房价的方式，招标确定住宅项目开发建设单位，由中标单位按照约定标准建设，按照约定价位面向符合条件的居民销售的中低价位、中小套型普通商品住房。销售价格实行政府定价，定价原则按照比周边同类商品住房低20%-25%确定。
